消毒供应中心（CSSD）生产工作的第一个流程就是回收，根据卫生部的最新工作规范对于消毒供应中心这个职能部门的定义“消毒供应中心（Central sterile supply department–CSSD)是医院内承担各科室所有重复使用诊疗器械、器具和物品的清洗消毒、灭菌以及无菌物品供应的职能部门“，根据这个定义我们首先可以很明确的确定消毒供应中心回收的内容是『可以重复使用的诊疗器械、器具、物品』，明确了回收的内容就可以针对回收建立操作流程及工作内容，然后将操作流程及工作内容辅助于计算机系统进行管理。
具体来说，就是不可重复使用的需要临床科室进行处理，一般这些不可回收的有使用或未使用的棉签、棉球、纱布等，诊疗过程中产生的血块、体液，一次性包装材料（塑封袋、包装纸、纸袋、无纺布等）；可重复使用的则回收至消毒供应中心，具体包括污染后的可重复使用的手术器械、器具（导线、器皿等）与物品（手术器材盒、手术衣、孔巾、托盘、可重复使用的包装材料等）。
明确了要回收的内容后，对于回收就好处理了，目前常见的回收工作流程有两种，一是由消毒供应中心主导，上门服务，在医院称之为”下收“，另外一种就是由科室主导，送货上门，一般会在消毒供应中心设置回收窗口等待科室来送。
对于下收这种流程来说，消毒供应中心很容易控制时间，可以集中时间段来进行回收，以好进行后续的清洗等工作，时间效率比较高，而且一般下收会有专用容器，对污染的控制比较好，不好的一面是临床科室的时间不好确定，而且在回收过程中可能会与临床科室之间产生时间安排上的矛盾，同时也会增加消毒供应中心的人力资源。
对于科室送货上门这种流程来说，消毒供应中心减少运送的工作量与人力成本，同时也会减少矛盾，不好的一面是采用这种方式往往都是科室使用时才去送污染的东西，然后再领用，将消毒供应中心当成一个仓库来使用，造成消毒供应中心管理成本提升，且不好安排后续的生产工作。对于临床科室也有往返时间的浪费及途中污染管理的问题。
由于能容易控制污染与时间，所以大多医院回收的主要流程都采取固定时间段下送的方式，辅助于临时情况也设置回收窗口。
回收存在消毒供应中心与临床科室交接，所以需要界定责任，主要界定的内容是回收交接的内容不能出错，如果出现错误也能很容易的发现并进行处理。
采用计算机系统与自动识别技术（条形码或RFID标签）对于回收的管理目标主要包括：器械包回收、单品回收、遗失处理、损坏处理、外来器械登记。同时建立回收日志。
下收主要采用基于Windows Mobile系统的手持终端来完成，器械包可使用条形码或RFID标签进行标识，人员同样也可以使用条形码或RFID标签来进行标识，通过扫描读取产生回收中的人、物、时间信息，形成回收日志，同时为下一步工作”清洗消毒“提供工作数据。
回收的数据可以作为当天消毒供应中心生产计划数据的一部分，另一部分数据来源于临床科室在科室终端的请领。